১৯৮২ সালে তিনি এবি ব্যাংক লিমিটেড, তত্কালীন আরব বাংলাদেশ ব্যাংকে শিক্ষানবিশ কর্মকর্তা হিসেবে ব্যাংকিং কর্মজীবন শুরু করেন। ২০১১ সালে তিনি আইপিডিসি ফাইন্যান্স লিমিটেডে এফআইয়ের সিনিয়র ম্যানেজমেন্টের সদস্য হিসেবে যোগদান করেন। ২০১৬ সালে তিনি যমুনা ব্যাংকে যোগদান করেন এবং করপোরেট ব্যাংকিং ও ক্রেডিট রিস্ক ম্যানেজমেন্ট ডিভিশনের প্রধান হিসেবে কর্মরত ছিলেন। ব্যাংক ম্যানেজমেন্টের ওপর দেশ ও বিদেশে প্রচুর প্রশিক্ষণ গ্রহণ করার পাশাপাশি ব্যাংকিং অপারেশনস ও পরিচালন বিষয়ে অভিজ্ঞতা রয়েছে তার।
ফজলে কাইয়ুম ১৯৮০ সালে ঢাকা বিশ্ববিদ্যালয়ের আইবিএ থেকে এমবিএ ডিগ্রি অর্জন করেন।